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來源: 發(fā)布時間:2022-01-05

PCR設計引物應遵循以下原則:①引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。②引物擴增跨度:以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物內部出現(xiàn)二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產生非特異的擴增條帶。⑤引物3'端的堿基,特別是較末及倒數(shù)第二個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。⑥引物中有或能加上合適的酶切位點,被擴增的靶序列比較好有適宜的酶切位點,這對酶切分析或分子克隆很有好處。⑦引物的特異性:引物應與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以比較低引物量產生所需要的結果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會。英瀚斯生物pcr檢測,保證真實實驗檢測,數(shù)據(jù)保密完整性。山東熒光定量pcr公司

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PCR實驗室設計的中心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴增產物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。由于一旦發(fā)生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結果必須作廢,需重新進行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應是預防,而不是排除。PCR擴增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增反應混合物配制和擴增區(qū)、擴增產物分析區(qū)。為避免交叉污染,進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行,即只能從試劑貯存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增反應混合物配制和擴增區(qū)→擴增產物分析區(qū)。 各實驗區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應通過傳遞窗進行。甘肅什么是pcr怎么選擇英瀚斯生物可承接臨床樣本、動物組織、細胞樣本各類pcr檢測。

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PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:

1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備。

2、模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈。重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍

PCR實驗過程一般分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結合,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性比較好)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。如圖所示:現(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是比較好也能在很短的時間內復制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行,以減少一次升降溫過程,提高了反應速度pcr實驗失敗的原因有哪些?

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PCR是一種具有選擇性的體外擴增DNA的片段的方法。其特異性由兩個人工合成的引物DNA序列決定。所謂引物是指與待擴增核酸片段兩端互補的寡核苷酸,其本質是ssDNA(單鏈DNA)的片段。指在引物指導下由酶催化的對特定模板(克隆或基因組DNA)的擴增反應,是模擬體內DNA復制過程,在體外特異性擴增基因片段的一種技術,在分子生物學中有普遍的應用,包括用于DNA作圖、DNA測序、分子系統(tǒng)遺傳學等。CR技術的基本原理類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復性,加入設計引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。簡述熒光定量pcr的基本原理。推薦pcr要多久

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PCR實驗技術中的RT-PCR介紹:在RT-PCR中,通過逆轉錄(RT)將RNA轉化為cDNA,然后通過聚合酶鏈式反應(PCR)擴增cDNA(圖1)。利用cDNA擴增步驟,有望對初始RNA進行進一步研究,即便RNA樣本數(shù)量有限或低豐度表達。RT-PCR的常見應用包括表達基因檢測、轉錄物變異檢測,以及克隆和測序用cDNA模板制備。由于逆轉錄可為PCR擴增和下游實驗提供cDNA模板,因此,它是實驗成功的關鍵步驟之一。選定的逆轉錄酶應對所有樣本均具有**高效率,即便是難轉錄RNA樣本,如降解、抑制劑殘留或具有高度二級結構的RNA樣本。一步法和兩步法是兩種**常用的RT-PCR方法,每種方法都具有各自的優(yōu)缺點。RNA的多聚酶反應(RT-PCR)是以RNA為模板,聯(lián)合逆轉錄反應(reversetranscription,RT)與PCR,可用于檢測單個細胞或少數(shù)細胞中少于10個拷貝的RNA模板。山東熒光定量pcr公司

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