miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR,miRNA與mRNA不同,成熟的miRNA的長度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆蓋其全長甚至有余,反向引物就無處安放了。那么如何實現miRNA的qPCR擴增呢?解決方案就是在逆轉錄的時候設法增加逆轉錄產物長度。普遍的方法有兩種,加尾法和莖環法。經過加尾法或莖環法這種特殊的逆轉錄形式處理之后,得到的cDNA長度從原始的20nt增加到80nt以上,這樣就能夠實現miRNA的qPCR擴增了。RNA逆轉錄實驗注意事項:選擇合適的引物:但其對RNA的完整度和二級結構的要求較高,而且不適用于原核生物。隨機引物可以根據堿基情況結合到幾乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。逆轉錄經常與細胞惡性轉化有關,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉錄過程。蘇州一體化逆轉錄多少錢
逆轉錄酶是存在于RNA病毒體內的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實驗中的逆轉錄酶需要具有以下二種活性:依賴RNA的DNA聚合酶活性:以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性:以一條DNA鏈為模板合成互補的雙鏈DNA。在選擇逆轉錄酶時,建議選擇無RNaseH①活性(RNaseH-)的逆轉錄酶。具有RNaseH活性的逆轉錄酶的RNaseH活性會與聚合酶活性競爭RNA模板與DNA引物(或cDNA延伸鏈)形成的雜合鏈,并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的產量與長度。成都快速逆轉錄酶公司逆轉錄實驗過程需適當的RNA質量,過少或質量不佳將影響擴增效果。
逆轉錄的過程:生物體中的逆轉錄過程就比較復雜,比如逆轉錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風”,所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中,經常有些基因是重疊、嵌套結構,充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發酶來合成引物,它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA,在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉錄。之后水解RNA鏈的時候,會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列,還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結構。
miRNA逆轉錄莖環法:首先需要進行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設計。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會形成二聚體時才能用。取200ul的PCR管,根據所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應體系說明,依次向200μL的PCR管內加入下列試劑:加樣結束后,移液器吹打混勻,低速離心數秒。將逆轉錄PCR管放入PCR擴增儀內,調整參數:37℃15min(反轉錄反應),85℃5s(反轉錄酶的失活反應),4℃∞。反應結束后根據實驗需要進行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉錄引物,注意相應地調整無酶水的體積和反應溫度。逆轉錄是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導下的DNA合成。
逆轉錄實驗步驟:用SSⅢ逆轉錄酶進行RT(20ul體積)1、準備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進行逆轉錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉錄酶。8、-20℃保存,或立即進行PCR。MCERTmix含有比例優化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉錄本的各個區域起始,并具有相同的逆轉錄效率,較大程度保證qPCR結果的真實性和可重復性。質粒RNA檢測中的逆轉錄反應需要特定反應體系。蘇州一體化逆轉錄多少錢
逆轉錄酶是逆轉錄過程中的重要酶類。蘇州一體化逆轉錄多少錢
逆轉錄的端粒復制:逆轉錄經常與細胞惡性轉化有關,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉錄過程。所以相關研究可以為很多疾病的研究和防治提供幫助。逆轉錄酶抑制劑就一直是藥物研發熱點,例如抗HIV的nevirapine。逆轉錄酶缺乏校對(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出錯。這也是很多病毒容易突變進化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不過,校對功能與逆轉錄活性并不矛盾。有人使用改良的定向進化策略從具有校對功能的DNA聚合酶(古細菌的DNA聚合酶B)進化出高保真的耐熱逆轉錄酶,稱為逆轉錄異種聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),證明校對與逆轉錄是兼容的。在科研中,RTX可用于RT-PCR等過程,能夠提高精確度及簡化操作程序。蘇州一體化逆轉錄多少錢
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