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來源: 發布時間:2023-04-26

miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR,miRNA加尾法逆轉錄:增加miRNA逆轉錄產物長度較直接的方法就是增加miRNA的長度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后進行逆轉錄反應。因此,加尾法是由兩個酶共同作用完成的,它們分別是PolyA聚合酶和逆轉錄酶。PolyA聚合酶負責給miRNA加上PolyA尾,增加其長度。之后逆轉錄引物結合到PolyA序列上,由逆轉錄酶完成加長版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR中的qPCR:miRNA熒光定量PCR的過程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆轉錄產物的5端均為通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根據miRNA序列設計的正向引物。正向引物的特異性就變得非常重要。對于內參,生工生物的miRNA加尾法首先鏈cDNA合成試劑盒(B532451)中內置了內參U6的正向引物,使用該引物與通用引物R即可進行內參U6的擴增。逆轉錄在病毒學、免疫學等領域有普遍的應用。重慶彩色逆轉錄試劑試劑研發

逆轉錄的過程:生物體中的逆轉錄過程就比較復雜,比如逆轉錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風”,所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中,經常有些基因是重疊、嵌套結構,充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發酶來合成引物,它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA,在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉錄。之后水解RNA鏈的時候,會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列,還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結構。長沙帶gDNA Remover逆轉錄混合逆轉錄在研究RNA表達調控等領域有普遍的應用前景。

反轉錄酶的注意事項,在進行RT反應之前,應考慮以下幾個方面:RNA:成功的cDNA合成來自高質量的RNA,高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。在提取RNA的過程中,要特別防止RNase的污染,同時在逆轉錄反應中經常加入RNase抑制劑以增加cDNA合成的長度和產量。RNase抑制劑要在首先鏈cDNA合成反應中,在緩沖液和還原劑(如DTT)存在的條件下加入,因為cDNA合成前的過程會使抑制劑變性,從而釋放結合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制劑只防止RNaseA,B,C對RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了這些抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase,實驗過程中經常更換新手套。

逆轉錄實驗的準備工作:1、實驗器具與材料:(1)移液頭:200ul、10ul;(2)吸頭:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、實驗器具的處理與準備,塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個浸泡于1‰DEPC水中(必要時小頭頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過夜,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時左右烘干),試驗前將頭頭放入吸頭臺。3、試劑配制和準備:(1)DEPC水:泡實驗器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時后備用。逆轉錄中所用的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶內裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過夜,送至高壓,后分裝到幾個1。5mlEP管中,-20℃中保存備用。(2)RT中所需要的各種試劑。逆轉錄的目的是將RNA變為DNA,便于PCR擴增。

反轉錄酶(reversetranscriptase,也可寫成逆轉錄酶)又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中發現了一種特殊的DNA聚合酶,該酶以RNA為模板,以dNTP為底物,tRNA(主要是色氨酸tRNA)為引物,在tRNA3'-OH末端上,根據堿基配對的原則,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補DNA(complementaryDNA,CDNA)。反轉錄酶(Reversetranscriptase)是以RNA為模板指導三磷酸脫氧核苷酸合成互補DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉錄酶和鼠類B型病毒的反轉錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉錄酶則由兩上亞基結構。真核生物中也都分離出具有不同結構的反轉錄酶。逆轉錄實驗過程中要使用干燥無菌的管頭和標本采集器避免受外界污染。長沙帶gDNA Remover逆轉錄混合

逆轉錄技術可以進行從RNA到DNA的轉化,從而保護RNA序列的完整性。重慶彩色逆轉錄試劑試劑研發

逆轉錄常見問題及解決方法之RNA濃度不高:a)、原始組織樣本或細胞量太少:提高加入量。b)、RNA發生降解:如果使用者確定提取RNA的試劑/器具沒有問題,RNA的降解通常發生在樣品破碎/勻漿階段。有兩個辦法可以徹底抑制內源RNase活性:1.立即加入裂解液并且徹底而迅速地勻漿。這只適合培養細胞及內源RNase含量較低的并且較容易勻漿的組織,2.對于內源RNase含量高或不易勻漿的組織,如肝臟、胰腺、脾臟、肌肉等,或植物組織,需要切成小塊后立即投入液氮冷凍,再按說明進行破碎/勻漿。c)、加入異丙醇后室溫沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,無需過夜沉淀。重慶彩色逆轉錄試劑試劑研發

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