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來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-05-02

RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄引物設(shè)計(jì)原則:1.上下游引物要保守:擴(kuò)增子長(zhǎng)度需選擇一段保守片段(100-200bp)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,選擇片段需跨越內(nèi)含子,因內(nèi)含子的基因組DNA序列不會(huì)被擴(kuò)增,也可減少?gòu)奈廴镜幕蚪MDNA中擴(kuò)增得到的假陽(yáng)性風(fēng)險(xiǎn)。引物選取同樣需要保守。2.引物長(zhǎng)度和Tm值:引物設(shè)計(jì)長(zhǎng)度為18-25bp,Tm值在50-65℃之間,引物中GC含量在40-60%。設(shè)計(jì)引物時(shí)盡量避免出現(xiàn)4個(gè)或超過(guò)4個(gè)G堿基。RT-PCR實(shí)驗(yàn)陰性對(duì)照:反轉(zhuǎn)錄陰性對(duì)照應(yīng)包括在所有的RT-PCR的實(shí)驗(yàn)中,用來(lái)檢測(cè)DNA是否污染(如基因組DNA或PCR產(chǎn)物)。該對(duì)照所指不加反轉(zhuǎn)錄酶,通過(guò)反轉(zhuǎn)錄過(guò)程得到cDNA在進(jìn)行熒光定量PCR檢測(cè)。如檢測(cè)到擴(kuò)增,則樣本中可能含有基因組DNA污染。逆轉(zhuǎn)錄也可作為RNA表達(dá)譜的分析方法。帶gDNA Remover逆轉(zhuǎn)錄酶公司

逆轉(zhuǎn)錄酶實(shí)驗(yàn)一步法與兩步法具有以下區(qū)別:一步法比兩步法更快速、簡(jiǎn)便、減少了污染機(jī)會(huì)、減少了RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)、減少了PCR反應(yīng)的錯(cuò)配率;兩步法的優(yōu)勢(shì)在于中間產(chǎn)物cDNA,便于保存;且第二步PCR只取逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)產(chǎn)物的1/10進(jìn)行反應(yīng),有利于PCR條件的調(diào)整,實(shí)驗(yàn)重現(xiàn)性強(qiáng);兩步法可以在第二步PCR反應(yīng)體系中加入特異性引物,其靈敏度比一步法高;兩步法包括首先鏈cDNA合成和隨后的PCR反應(yīng),容易產(chǎn)生污染問(wèn)題;兩步法的實(shí)驗(yàn)預(yù)算要低于一步法。杭州反轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前應(yīng)反復(fù)檢查所有試劑盒的有效期和使用條件。

逆轉(zhuǎn)錄是指以RNA為模板合成與其互補(bǔ)的cDNA的過(guò)程。逆轉(zhuǎn)錄PCR是將RNA的逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)和cDNA的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)相結(jié)合的技術(shù),故逆轉(zhuǎn)錄稱為RT-PCR或反轉(zhuǎn)錄PCR。逆轉(zhuǎn)錄PCR實(shí)驗(yàn)原理是,提取組織或細(xì)胞中的總RNA,以RNA為模板,利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再以cDNA鏈為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而獲得大量拷貝。逆轉(zhuǎn)錄PCR的出現(xiàn)使RNA檢測(cè)的靈敏性提高了幾個(gè)數(shù)量級(jí),使一些極為微量RNA樣品分析成為可能。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):選擇合適的引物:隨機(jī)引物法逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的片段較小,很難得到全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本的cDNA。單獨(dú)選擇某一種引物,實(shí)驗(yàn)可能都不完美,具體需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康膩?lái)確定。

逆轉(zhuǎn)錄是一種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,它在生物體內(nèi)發(fā)揮著重要的作用。逆轉(zhuǎn)錄是指將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA的過(guò)程,與正常的DNA轉(zhuǎn)錄成RNA的過(guò)程相反。這個(gè)過(guò)程由逆轉(zhuǎn)錄酶來(lái)完成,而逆轉(zhuǎn)錄酶是一種酶類蛋白質(zhì),普遍存在于病毒和一些細(xì)胞中。逆轉(zhuǎn)錄的重要性在于它是某些病毒的復(fù)制過(guò)程中必不可少的一步。許多病毒的遺傳物質(zhì)是RNA分子,而它們必須先將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA,才能利用細(xì)胞的合成機(jī)制來(lái)進(jìn)行復(fù)制。這種轉(zhuǎn)錄過(guò)程一旦完成,病毒的DNA就可以與宿主細(xì)胞的DNA結(jié)合在一起,從而使病毒的遺傳物質(zhì)被復(fù)制并傳遞下去。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)中引物設(shè)計(jì)時(shí)要注意反向引物特異性和長(zhǎng)度,避免循環(huán)擴(kuò)增和特異性問(wèn)題。

逆轉(zhuǎn)錄的端粒復(fù)制:對(duì)于線性基因組,其滯后鏈的末端是無(wú)法完整復(fù)制的,每次約損失30-200個(gè)核苷酸(Cells.2020Feb22;9(2).)。這樣隨著細(xì)胞分裂,端粒會(huì)持續(xù)縮短,造成復(fù)制性衰老。對(duì)于大多數(shù)體細(xì)胞來(lái)說(shuō),端粒磨損是一種控制其分裂潛力的機(jī)制,但對(duì)于需要多次增殖的干細(xì)胞來(lái)說(shuō),必須設(shè)法維持端粒長(zhǎng)度。端粒酶(telomerase)可以通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程延長(zhǎng)端粒。端粒酶由端粒酶RNA(TERC)和端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(TERT)組成。TERT使用TERC作為模板,在染色體的單鏈末端合成端粒DNA的重復(fù)序列。大多數(shù)體細(xì)胞缺乏端粒酶活性,因而容易衰老。但未分化的生殖細(xì)胞,干細(xì)胞,活化的淋巴細(xì)胞和大多數(shù)疙瘩細(xì)胞具有高水平的端粒酶活性,可以克服端粒磨損并維持無(wú)限的細(xì)胞分裂。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)后的DNA的片段可用于測(cè)序等高通量技術(shù)。重慶莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄多少錢

HIV病毒復(fù)制的一個(gè)重要步驟就是逆轉(zhuǎn)錄。帶gDNA Remover逆轉(zhuǎn)錄酶公司

反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項(xiàng),引物的選擇,OligodT:選擇OligodT時(shí),要求RNA必須有PolyA,所以真核生物的mRNA都適用。適合長(zhǎng)鏈甚至全長(zhǎng)mRNA的RT,所以對(duì)RNA樣品的質(zhì)量要求較高,較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng),建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機(jī)引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。特異性引物:特異性引物只能用你設(shè)計(jì)引物時(shí)的下游引物做RT,引物設(shè)計(jì)質(zhì)量影響RT的結(jié)果,而且不同引物退火溫度本來(lái)就不相同,所以按照說(shuō)明書按照一個(gè)溫度做不是較佳選擇,一般不推薦。帶gDNA Remover逆轉(zhuǎn)錄酶公司

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